Segmentation methods for array CGH analysis.

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cghseg is an R package dedicated to the analysis of CGH profiles using segmentation models

Mots clés

Array CGH; Dynamic programming; Joint segmentation; Wave effect

Lien vers l'élément du SI MIA

https://cran.r-project.org/web/packages/cghseg/

Informations générales

Statut

À disposition

Manuel de référence

https://cran.r-project.org/web/packages/cghseg/cghseg.pdf

Suivi

Non renseigné

Informations spécifiques

Langage(s) de développement

R

Langage(s) d'interface

R

N° de version courante

V1.0.2-1

Date de la version courante

2016-01-03

OS supporté

indifférent

Type de licence

GPLv2

Etat

Développement arrêté

Porteur(s)

Unité

MIA-Paris

Equipe

Statistique et Génome

Auteur(s)

Picard Franck

Hoebeke Mark

Lebarbier Emilie

Miele Vincent

Rigaill Guillem

Robin Stephane

Publication de référence

https://dx.doi.org/10.1093/biostatistics/kxq076

 

 

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